2000年4月、北海道大学歯学部・大学院歯学研究科は大学院重点化に伴って改組され、大学院歯学研究科に3大講座(口腔機能学講座、口腔健康科学講座、口腔病態学講座)が設置された。これに伴い、口腔健康科学講座に高齢者口腔健康管理学分野と加齢歯科学分野が新設された。
　2000年10月、北海道大学歯学部附属病院特殊歯科治療部助教授の井上農夫男が高齢者口腔健康管理学分野初代教授として就任し、2001年4月、北海道大学大学院歯学研究科口腔機能学講座咀嚼機能回復学分野(旧歯科補綴学第一講座)助教授の野谷健治が加齢歯科学分野初代助教授として移籍した。
　2004年4月、高齢者口腔健康管理学分野と加齢歯科学分野が合併し、高齢者歯科学教室と名称変更された。
　2011年3月、11年間にわたり教室の発展に尽力された井上教授が定年退任し、2013年8月、北海道大学病院口腔系歯科講師の山崎裕が第2代教授に就任した。現在は山崎教授のもと、教室員が一丸となって教育、研究、臨床に励んでいる。